Dentro de La Primavera los tipos predominantes de vegetación son: Bosque de encino, (Quercus), Bosque de encino-pino (Quercus-Pinus), Bosque de pino (Pinus), Bosque tropical caducifolio; existen 5 diferentes especies de pinos y 11 especies de encinos, la altura promedio es entre 5 y 15 metros de altura, también existen tres comunidades vegetales; Rupicula aquellas plantas que se desarrollan sobre las rocas; Ruderal se establecen principalmente en la apertura de caminos y áreas de cultivo y Riparia aquella que se establece en los márgenes de los ríos, arroyos permanentes y temporales.
Además existe una gran diversidad de plantas.
Estudios preliminares sobre la flora del APFFLP reportan la presencia de nueve especies de plantas endémicas de Jalisco en el APFFLP
En promedio 795 especies de plantas
255 de hongos
cada una de estas cumplen funciones muy importantes para el equilibrio ecológico de la zona, por ello no debes extraerlas del sitio dónde se encuentran.
